扩张型心肌病的基因型-表型关联及表型聚类 vs. 基因型分类的预后价值比较

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扩张型心肌病(DCM)是一种以心室扩张和收缩功能障碍为特征的心肌疾病,是导致心力衰竭和心律失常的重要原因。目前已知高达40%的DCM病例具有单基因病因。认识基因型与临床表型的关联,对于理解疾病机制、实现个体化风险分层和精准治疗决策至关重要。

临床实践表明,即使是同一基因型的患者,其疾病表现和预后也存在显著的异质性,为临床风险分层带来了巨大挑战。虽然已有研究开发了针对特定基因(如 LMNA 或 PLN)的风险预测模型,但这些工具仅适用于少数基因,且由于疾病表达、心律失常负荷和心脏重构的差异,这些模型通常无法推广到其他基因型。对于大多数罕见基因型,由于队列规模有限,难以构建基因特异性模型。因此,寻找一种能够跨越基因型、基于临床特征的风险分层框架,已成为一个重要的研究方向。表型聚类是一种无监督的机器学习方法,既往研究已在包括遗传性和非遗传性DCM的混合队列中应用了该方法,证明了其在识别亚型方面的价值。然而,迄今为止,尚未有研究在一个完全由基因型阳性DCM患者组成的队列中,系统评估表型分型方法的应用价值。

 

该研究利用一个大型、多中心的基因型阳性DCM队列,旨在实现以下三个目标:(1) 详细描绘不同基因型的特异性临床特征;(2) 评估基于临床表型的无监督聚类是否能预测患者的基因型;(3) 比较基于基因型分类和基于表型聚类的两种策略在长期预后方面的预测价值。

 

研究方法

PART

01

 

该研究是一项多中心研究。研究对象来自五个三级医疗中心的遗传性心脏病和心力衰竭门诊。研究最终纳入534名基因型阳性的DCM患者(均为先证者)。

 

所有患者在2014年后均接受了基于靶向二代测序的基因检测。检测 panel 至少覆盖了19个与DCM最密切相关的基因(包括 ACTC1、BAG3、DMD、DES、DSP、EMD、FLNC、LMNA、MYH7、NEXN、PLN、RBM20、SCN5A、TTN、TNNC1、TNNI3、TNNT2、TPM1 和 VCL)。仅携带致病或可能致病(P/LP)变异的个体被定义为基因型阳性。

 

基线定义为基因型阳性DCM患者的首次门诊就诊时间。收集的数据包括人口统计学信息(年龄、性别)、年龄、心功能分级、血压、DCM家族史、辅助检查等。对于缺失数据,采用了混合数据因子分析(FAMD)方法进行插补。

 

研究采用了基于主成分的层次聚类(HCPC)方法进行表型聚类。首先,通过FAMD对17个临床变量进行降维,提取主成分。最优的主成分维度和聚类数通过交叉验证和NbClust包综合确定。聚类过程使用曼哈顿距离和完全连锁法。

 

研究的主要终点是复合终点,包括全因死亡、因心力衰竭住院(HFH)、心脏移植(HTx)和恶性室性心律失常(MVA)。次要终点是心衰相关事件(HFH和HTx的复合终点)和MVA。随访截止日期为2024年2月1日。

 

每个聚类或基因型中变量的代表程度(过度代表/不足代表)采用v检验进行分析,该分析通过FactoMineR包的catdes函数进行。采用Kaplan-Meier法和log-rank检验比较不同组别的累积事件发生率。使用Cox比例风险回归模型评估基因型或表型状态与无事件生存期的关联,并对年龄、性别、基线LVEF等进行校正。聚类与基因型之间的一致性通过校正后的兰德指数(Adjusted Rand Index)进行评估。

 

研究结果

PART

02

 

一、遗传学特征及其与临床特征的关联

 

534名存在P/LP变异的DCM患者中,最常见的致病变异基因为 TTN,其次是 LMNA、FLNC等(图1)。 不同遗传变异与特定的临床特征存在显著关联,FLNC、LMNA、DSP 和 PLN 变异与较高的心律失常负荷(如非持续性室速、房颤、房室传导阻滞)显著相关。 BAG3、TNNT2、DMD 和 TTN 变异则与显著增加的心室容积和降低的LVEF相关(图1)。

 

 

二、基于临床特征的表型聚类分析

 

基于17个临床变量的无监督聚类分析,将全部患者划分为四个互斥的临床表型(图2):表型1(C1,n=163): 年轻(诊断中位年龄38岁),LVEF中度降低(平均43%),心律失常(如房颤、非持续性室速)发生率低。表型2(C2,n=106): 年龄较大(57岁),LVEF中度降低(44%),但基线心律失常负荷高(如房颤55%,非持续性室速49%)。表型3(C3,n=119): 相对年轻(43岁),LVEF严重降低(平均24%),非持续性室速发生率高(67%)。表型4(C4,n=146): 年龄较大(55岁),LVEF严重降低(27%),且心律失常负荷高(房颤30%,非持续性室速55%)。

 

 

没有任何一种基因变异是某个表型所独有的。几乎所有基因型都分布在四个表型中。校正后的兰德指数仅为0.024,一致性接近随机水平。

 

三、基因型与表型的预后价值比较

 

在中位7.6年的随访期间,175名(33%)患者达到了主要复合终点。次要终点(心力衰竭事件或心律失常事件)分别发生在112例(21%)和67例患者(13%)中。

 

LMNA、FLNC 和 BAG3 变异患者的复合终点风险最高(图3)。在校正年龄、性别和LVEF后,存在高风险基因变异的患者仍显示出显著更高的心力衰竭事件和心律失常事件风险(图4)。

 

在不同表型中,C3和C4的患者预后最差。其中,C4的心力衰竭事件风险最高,而C3的心律失常事件风险最高(图3-4)。

 

为了比较基因型和临床表型何者对结局的贡献更显著,研究采用了对数似然比卡方统计量(似然比χ²)比例作为比较指标。在所有结局指标(主要结局事件、HFH/HTx事件和MVA事件)中,基因型始终是最显著的预测因素,表型聚类的贡献较小,而传统的风险因素如LVEF、年龄和性别的贡献相对较低(图5)。

 

 

基因型阳性DCM患者存在显著的临床和遗传学异质性。独立于遗传信息进行的临床表型聚类与基因型的相关性不强,且预后价值有限,提示在此类人群中广泛开展基因检测的重要性。未来的DCM研究应关注基因特异性风险分层工具的开发与应用。

参考文献:

Stroeks SLVM, Wang P, Merlo M, et al. Impact of genotype-phenotype associations on prognosis in dilated cardiomyopathy.Eur J Heart Fail. 2025;27(12):3205-3218. doi:10.1002/ejhf.70040

 

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